学习心得共19篇
小鼠中枢神经系统脱髓鞘和再髓鞘脑细胞转录组图谱和相互作用网络
code:https://github.com/marcocolonnalab/CPZ 原文地址：https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(23)00304-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2...
2024/04/12
WordPress跨服务器迁移最简单的手段
最近把博客建好了以后，一直在考虑如果有一天换服务器怎么办。于是就想把wordpress迁移流程走一遍，以便以后根据需要进行迁移。在这个过程中，又走了很多弯路，费了很多时间。也有一个好处，就...
2022/05/12
单细胞测序（三）：寻找细胞标记
一、亚群注释 明确细胞类型。 1.识别每个类群的所有标记物； 2.识别每个类群的保留标记； 3.特定类群的标记识别。 1. 总体代码 markers <- FindAllMarkers(object = scRNA_harmony, test.use...
2023/08/16
文献阅读：脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应
摘要 研究人员利用高通量RNA测序（RNA-seq）技术，研究了脑膜对创伤性脑损伤（TBI）和衰老的转录反应，这一研究涵盖了亚急性和慢性的时间框架。研究人员首先使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）探索...
2024/01/18
在Windows系统的Edge中实现新bing（new bing）访问，解决cnbing重定向问题
背景 在新bing公测的时候，我第一时间加入了waitlist，并快速通过申请。前期也存在着cn.bing.com重定向问题，当时只需安装modheader等HTTP请求头修改插件便可解决此问题。 然而，天有不测风云，...
2023/03/28
单细胞分析（一）：矩阵数据的处理
一、总体代码 Seurat包官方文档https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial #加载所需R包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) library(ggplot2...
2023/08/14
整合空间转录组和代谢研究揭示人脑损伤后的代谢异质性
空间转录组学揭示损伤脑的独特分子区域化 为了探索TBI的细胞景观，研究人员收集了TBI患者手术后的脑挫伤组织，并基于10× Genomics进行单细胞RNA测序(RNA-seq)。细胞经过t分布随机邻居嵌入(tSNE...
2024/04/14
单细胞学习（五）：通过聚类角度判断哪些cluster可能属于同一细胞类型
1.总体代码 ##清空环境 rm(list=ls()) #设置工作路径 ###加载所需要的包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) x=list.files() dir = c('BC2/', 'BC21/') nam...
2023/12/12
R语言自作笔记
R语言字母向量： LETTERS: the 26 upper-case letters of the Roman alphabet; letters: the 26 lower-case letters of the Roman alphabet; month.abb: the three-letter abbreviations for th...
2022/05/13
Hello, world!
疯狂肝了两天，此博客终于稳定下来。现在也终于可以有些时间写下第一篇文章，纪念一下这几天的付出。 一、建站灵感 说起建站的理由，其实也很偶然。前几天我在接收outlook邮件的时候，突然发现o...
2022/05/10