学习心得共19篇 第2页
单细胞测序分析所用工作站配件选购、组装与配置
1.背景 常规家用电脑通常难以满足单细胞测序分析对于电脑的配置要求（CPU的线程与内存容量，内存通常需要256G以上）。虽然目前我的PC为128G，但该内存为非ECC内存，其最高128G的容量也难以满足...
2023/08/06
单细胞测序（四）：软件注释
一、singleR 1. 总体代码 #第二种方法用SingleR鉴定细胞类型 ###下载好数据库后，把ref_Human_all.Rdata加载到环境中，这样算是对数据库的加载，就可以按照singler的算法来对细胞亚群进行定义了...
2023/08/28ubuntu系统下R语言安装velocyto.R报错ERROR: compilation failed for package ‘velocyto.R’的解决方案
velocyto.R可用于RNA速率分析，在使用install_github('velocyto-team/velocyto.R')时，出现如下报错： ERROR: dependency ‘pcaMethods’ is not available for package ‘velocyto.R’<br>*...
2024/04/16单细胞测序（二）：多组单细胞数据的合并
单细胞的批次效应 批次：细胞以不同的分组处理时，可能发生批次效应。不同单细胞样本的数据合并通常有多种方式，包含锚定点法、Harmony、RPCA和SCTransform等。可以根据实际情况选择需要的合并...
2023/08/15
Hello, world!
疯狂肝了两天，此博客终于稳定下来。现在也终于可以有些时间写下第一篇文章，纪念一下这几天的付出。 一、建站灵感 说起建站的理由，其实也很偶然。前几天我在接收outlook邮件的时候，突然发现o...
2022/05/10
Linux系统通过密钥ssh登陆配置方法
一、制作密钥对 1.打开windows或者Mac OS中的powershell，输入 #生成密钥对 ssh-keygen -t RSA -b 2048 -C "your@domain.com" #-t 后表示ssh的密钥类型，常用的有：rsa、ed25519、dss...
2023/08/07
整合空间转录组和代谢研究揭示人脑损伤后的代谢异质性
空间转录组学揭示损伤脑的独特分子区域化 为了探索TBI的细胞景观，研究人员收集了TBI患者手术后的脑挫伤组织，并基于10× Genomics进行单细胞RNA测序(RNA-seq)。细胞经过t分布随机邻居嵌入(tSNE...
2024/04/14
WordPress跨服务器迁移最简单的手段
最近把博客建好了以后，一直在考虑如果有一天换服务器怎么办。于是就想把wordpress迁移流程走一遍，以便以后根据需要进行迁移。在这个过程中，又走了很多弯路，费了很多时间。也有一个好处，就...
2022/05/12
文献学习2:创伤性脑损伤导致由小胶质细胞介导的慢性皮质炎症和神经元功能障碍
文献学习 Title：Traumatic Brain Injury Causes Chronic Cortical Inflammation and Neuronal Dysfunction Mediated by Microglia DOI: https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.2469-20.2020 题目...
2023/09/09