创建博客主要有两个目的，一个是用作笔记，另一个则是写一些日常随想。 最初的预想是将两个目的合在一个博客里，既省事，所作的笔记又可以给随想引流。 然而， 当真正提笔想要写些随想的时候，...

一、亚群注释 明确细胞类型。 1.识别每个类群的所有标记物； 2.识别每个类群的保留标记； 3.特定类群的标记识别。 1. 总体代码 markers <- FindAllMarkers(object = scRNA_harmony, test.use...

摘要 研究人员利用高通量RNA测序（RNA-seq）技术，研究了脑膜对创伤性脑损伤（TBI）和衰老的转录反应，这一研究涵盖了亚急性和慢性的时间框架。研究人员首先使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）探索...

一、singleR 1. 总体代码 #第二种方法用SingleR鉴定细胞类型 ###下载好数据库后，把ref_Human_all.Rdata加载到环境中，这样算是对数据库的加载，就可以按照singler的算法来对细胞亚群进行定义了...

文献学习 Title：Traumatic Brain Injury Causes Chronic Cortical Inflammation and Neuronal Dysfunction Mediated by Microglia DOI: https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.2469-20.2020 题目...

code:https://github.com/marcocolonnalab/CPZ 原文地址：https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(23)00304-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2...

1.总体代码 ##清空环境 rm(list=ls()) #设置工作路径 ###加载所需要的包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) x=list.files() dir = c('BC2/', 'BC21/') nam...

一、总体代码 Seurat包官方文档https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial #加载所需R包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) library(ggplot2...

1.conda安装包提示Solving environment: unsuccessful initial attempt using frozen solve. Retrying with flexible solve 使用 Conda 安装包时遇到 “Solving environment: unsuccessful init...

一、制作密钥对 1.打开windows或者Mac OS中的powershell，输入 #生成密钥对 ssh-keygen -t RSA -b 2048 -C "your@domain.com" #-t 后表示ssh的密钥类型，常用的有：rsa、ed25519、dss...

R语言字母向量： LETTERS: the 26 upper-case letters of the Roman alphabet; letters: the 26 lower-case letters of the Roman alphabet; month.abb: the three-letter abbreviations for th...