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随想改为独立板块,更安静的阅读空间
创建博客主要有两个目的,一个是用作笔记,另一个则是写一些日常随想。 最初的预想是将两个目的合在一个博客里,既省事,所作的笔记又可以给随想引流。 然而, 当真正提笔想要写些随想的时候,...
Hello, world!
疯狂肝了两天,此博客终于稳定下来。现在也终于可以有些时间写下第一篇文章,纪念一下这几天的付出。 一、建站灵感 说起建站的理由,其实也很偶然。前几天我在接收outlook邮件的时候,突然发现o...
单细胞测序(四):软件注释
一、singleR 1. 总体代码 #第二种方法用SingleR鉴定细胞类型 ###下载好数据库后,把ref_Human_all.Rdata加载到环境中,这样算是对数据库的加载,就可以按照singler的算法来对细胞亚群进行定义了...
整合空间转录组和代谢研究揭示人脑损伤后的代谢异质性
空间转录组学揭示损伤脑的独特分子区域化 为了探索TBI的细胞景观,研究人员收集了TBI患者手术后的脑挫伤组织,并基于10× Genomics进行单细胞RNA测序(RNA-seq)。细胞经过t分布随机邻居嵌入(tSNE...
ubuntu系统下R语言安装velocyto.R报错ERROR: compilation failed for package ‘velocyto.R’的解决方案
velocyto.R可用于RNA速率分析,在使用install_github('velocyto-team/velocyto.R')时,出现如下报错: ERROR: dependency ‘pcaMethods’ is not available for package ‘velocyto.R’<br>*...
WordPress跨服务器迁移最简单的手段
最近把博客建好了以后,一直在考虑如果有一天换服务器怎么办。于是就想把wordpress迁移流程走一遍,以便以后根据需要进行迁移。在这个过程中,又走了很多弯路,费了很多时间。也有一个好处,就...
颅脑CT基础:CT断层解剖结构
一、颅CT基础 1.三种常用头颅扫描基线 (1)常规:横轴位(眦耳线),层厚8~10 mm (2)横轴位(眦耳线):上眶耳线(眦耳线向后倾斜20°) (3)鞍区扫描等 2.密度分类 低密度(黑-透光):空...
Linux系统通过密钥ssh登陆配置方法
一、制作密钥对 1.打开windows或者Mac OS中的powershell,输入 #生成密钥对 ssh-keygen -t RSA -b 2048 -C "your@domain.com" #-t 后表示ssh的密钥类型,常用的有:rsa、ed25519、dss...
文献阅读:脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应
摘要 研究人员利用高通量RNA测序(RNA-seq)技术,研究了脑膜对创伤性脑损伤(TBI)和衰老的转录反应,这一研究涵盖了亚急性和慢性的时间框架。研究人员首先使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)探索...
单细胞学习(五):通过聚类角度判断哪些cluster可能属于同一细胞类型
1.总体代码 ##清空环境 rm(list=ls()) #设置工作路径 ###加载所需要的包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) x=list.files() dir = c('BC2/', 'BC21/') nam...
python常见问题解决汇总(持续更新)
1.conda安装包提示Solving environment: unsuccessful initial attempt using frozen solve. Retrying with flexible solve 使用 Conda 安装包时遇到 “Solving environment: unsuccessful init...