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单细胞测序(二):多组单细胞数据的合并-吃了吃了

单细胞测序(二):多组单细胞数据的合并

单细胞的批次效应 批次:细胞以不同的分组处理时,可能发生批次效应。不同单细胞样本的数据合并通常有多种方式,包含锚定点法、Harmony、RPCA和SCTransform等。可以根据实际情况选择需要的合并...
drqux的头像-吃了吃了drqux2023/08/15
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整合空间转录组和代谢研究揭示人脑损伤后的代谢异质性-吃了吃了

整合空间转录组和代谢研究揭示人脑损伤后的代谢异质性

空间转录组学揭示损伤脑的独特分子区域化 为了探索TBI的细胞景观,研究人员收集了TBI患者手术后的脑挫伤组织,并基于10× Genomics进行单细胞RNA测序(RNA-seq)。细胞经过t分布随机邻居嵌入(tSNE...
drqux的头像-吃了吃了drqux2024/04/14
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文献阅读:增强星形胶质细胞内的内源性大麻素信号可促进创伤性脑损伤的恢复-吃了吃了

文献阅读:增强星形胶质细胞内的内源性大麻素信号可促进创伤性脑损伤的恢复

Title: Enhancing endocannabinoid signalling in astrocytes promotes recovery from traumatic brain injury DOI: https://doi.org/10.1093/brain/awab310 创伤性脑损伤是阿尔茨海默病和痴呆...
drqux的头像-吃了吃了drqux2023/08/29
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在Windows系统的Edge中实现新bing(new bing)访问,解决cnbing重定向问题-吃了吃了

在Windows系统的Edge中实现新bing(new bing)访问,解决cnbing重定向问题

背景 在新bing公测的时候,我第一时间加入了waitlist,并快速通过申请。前期也存在着cn.bing.com重定向问题,当时只需安装modheader等HTTP请求头修改插件便可解决此问题。 然而,天有不测风云,...
单细胞分析(一):矩阵数据的处理-吃了吃了

单细胞分析(一):矩阵数据的处理

一、总体代码 Seurat包官方文档https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial #加载所需R包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) library(ggplot2...
drqux的头像-吃了吃了drqux2023/08/14
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文献学习2:创伤性脑损伤导致由小胶质细胞介导的慢性皮质炎症和神经元功能障碍-吃了吃了

文献学习2:创伤性脑损伤导致由小胶质细胞介导的慢性皮质炎症和神经元功能障碍

文献学习 Title:Traumatic Brain Injury Causes Chronic Cortical Inflammation and Neuronal Dysfunction Mediated by Microglia DOI: https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.2469-20.2020 题目...
颅脑CT基础:CT断层解剖结构-吃了吃了

颅脑CT基础:CT断层解剖结构

一、颅CT基础 1.三种常用头颅扫描基线 (1)常规:横轴位(眦耳线),层厚8~10 mm (2)横轴位(眦耳线):上眶耳线(眦耳线向后倾斜20°) (3)鞍区扫描等 2.密度分类 低密度(黑-透光):空...
利用frp构建内网穿透服务-吃了吃了

利用frp构建内网穿透服务

一、frps通过docker进行服务器端配置 1.首先在/etc下新建文件夹frp,通过vim命令新建frps.ini文件如下 [common] # 监听端口 bind_port = 0000 # 面板端口 dashboard_port = 0000 # 登录面板账号...
drqux的头像-吃了吃了drqux2022/08/16
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小鼠中枢神经系统脱髓鞘和再髓鞘脑细胞转录组图谱和相互作用网络-吃了吃了

小鼠中枢神经系统脱髓鞘和再髓鞘脑细胞转录组图谱和相互作用网络

code:https://github.com/marcocolonnalab/CPZ 原文地址:https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(23)00304-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2...
drqux的头像-吃了吃了drqux2024/04/12
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ubuntu系统下R语言安装velocyto.R报错ERROR: compilation failed for package ‘velocyto.R’的解决方案-吃了吃了

ubuntu系统下R语言安装velocyto.R报错ERROR: compilation failed for package ‘velocyto.R’的解决方案

velocyto.R可用于RNA速率分析,在使用install_github('velocyto-team/velocyto.R')时,出现如下报错: ERROR: dependency ‘pcaMethods’ is not available for package ‘velocyto.R’<br>*...
drqux的头像-吃了吃了drqux2024/04/16
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