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R语言自作笔记
R语言字母向量： LETTERS: the 26 upper-case letters of the Roman alphabet; letters: the 26 lower-case letters of the Roman alphabet; month.abb: the three-letter abbreviations for th...
2022/05/13
利用frp构建内网穿透服务
一、frps通过docker进行服务器端配置 1.首先在/etc下新建文件夹frp，通过vim命令新建frps.ini文件如下 [common] # 监听端口 bind_port = 0000 # 面板端口 dashboard_port = 0000 # 登录面板账号...
2022/08/16单细胞测序分析所用工作站配件选购、组装与配置
1.背景 常规家用电脑通常难以满足单细胞测序分析对于电脑的配置要求（CPU的线程与内存容量，内存通常需要256G以上）。虽然目前我的PC为128G，但该内存为非ECC内存，其最高128G的容量也难以满足...
2023/08/06
Linux系统通过密钥ssh登陆配置方法
一、制作密钥对 1.打开windows或者Mac OS中的powershell，输入 #生成密钥对 ssh-keygen -t RSA -b 2048 -C "your@domain.com" #-t 后表示ssh的密钥类型，常用的有：rsa、ed25519、dss...
2023/08/07
单细胞分析（一）：矩阵数据的处理
一、总体代码 Seurat包官方文档https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial #加载所需R包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) library(ggplot2...
2023/08/14单细胞测序（二）：多组单细胞数据的合并
单细胞的批次效应 批次：细胞以不同的分组处理时，可能发生批次效应。不同单细胞样本的数据合并通常有多种方式，包含锚定点法、Harmony、RPCA和SCTransform等。可以根据实际情况选择需要的合并...
2023/08/15
单细胞测序（三）：寻找细胞标记
一、亚群注释 明确细胞类型。 1.识别每个类群的所有标记物； 2.识别每个类群的保留标记； 3.特定类群的标记识别。 1. 总体代码 markers <- FindAllMarkers(object = scRNA_harmony, test.use...
2023/08/16
单细胞测序（四）：软件注释
一、singleR 1. 总体代码 #第二种方法用SingleR鉴定细胞类型 ###下载好数据库后，把ref_Human_all.Rdata加载到环境中，这样算是对数据库的加载，就可以按照singler的算法来对细胞亚群进行定义了...
2023/08/28
文献阅读：增强星形胶质细胞内的内源性大麻素信号可促进创伤性脑损伤的恢复
Title: Enhancing endocannabinoid signalling in astrocytes promotes recovery from traumatic brain injury DOI: https://doi.org/10.1093/brain/awab310 创伤性脑损伤是阿尔茨海默病和痴呆...
2023/08/29
Hello, world!
疯狂肝了两天，此博客终于稳定下来。现在也终于可以有些时间写下第一篇文章，纪念一下这几天的付出。 一、建站灵感 说起建站的理由，其实也很偶然。前几天我在接收outlook邮件的时候，突然发现o...
2022/05/10