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随想改为独立板块，更安静的阅读空间
创建博客主要有两个目的，一个是用作笔记，另一个则是写一些日常随想。 最初的预想是将两个目的合在一个博客里，既省事，所作的笔记又可以给随想引流。 然而， 当真正提笔想要写些随想的时候，...
2024/05/03
python常见问题解决汇总（持续更新）
1.conda安装包提示Solving environment: unsuccessful initial attempt using frozen solve. Retrying with flexible solve 使用 Conda 安装包时遇到 “Solving environment: unsuccessful init...
2024/04/12
ubuntu系统下R语言安装velocyto.R报错ERROR: compilation failed for package ‘velocyto.R’的解决方案
velocyto.R可用于RNA速率分析，在使用install_github('velocyto-team/velocyto.R')时，出现如下报错： ERROR: dependency ‘pcaMethods’ is not available for package ‘velocyto.R’<br>*...
2024/04/16
单细胞学习（五）：通过聚类角度判断哪些cluster可能属于同一细胞类型
1.总体代码 ##清空环境 rm(list=ls()) #设置工作路径 ###加载所需要的包 library(Seurat) library(tidyverse) library(dplyr) library(patchwork) x=list.files() dir = c('BC2/', 'BC21/') nam...
2023/12/12
在Windows系统的Edge中实现新bing（new bing）访问，解决cnbing重定向问题
背景 在新bing公测的时候，我第一时间加入了waitlist，并快速通过申请。前期也存在着cn.bing.com重定向问题，当时只需安装modheader等HTTP请求头修改插件便可解决此问题。 然而，天有不测风云，...
2023/03/28
小鼠中枢神经系统脱髓鞘和再髓鞘脑细胞转录组图谱和相互作用网络
code:https://github.com/marcocolonnalab/CPZ 原文地址：https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(23)00304-2?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2...
2024/04/12利用frp构建内网穿透服务
一、frps通过docker进行服务器端配置 1.首先在/etc下新建文件夹frp，通过vim命令新建frps.ini文件如下 [common] # 监听端口 bind_port = 0000 # 面板端口 dashboard_port = 0000 # 登录面板账号...
2022/08/16单细胞测序（二）：多组单细胞数据的合并
单细胞的批次效应 批次：细胞以不同的分组处理时，可能发生批次效应。不同单细胞样本的数据合并通常有多种方式，包含锚定点法、Harmony、RPCA和SCTransform等。可以根据实际情况选择需要的合并...
2023/08/15
颅脑CT基础：CT断层解剖结构
一、颅CT基础 1.三种常用头颅扫描基线 （1）常规：横轴位（眦耳线），层厚8~10 mm （2）横轴位（眦耳线）：上眶耳线（眦耳线向后倾斜20°） （3）鞍区扫描等 2.密度分类 低密度（黑-透光）：空...
2023/09/05
单细胞测序（三）：寻找细胞标记
一、亚群注释 明确细胞类型。 1.识别每个类群的所有标记物； 2.识别每个类群的保留标记； 3.特定类群的标记识别。 1. 总体代码 markers <- FindAllMarkers(object = scRNA_harmony, test.use...
2023/08/16
文献阅读：增强星形胶质细胞内的内源性大麻素信号可促进创伤性脑损伤的恢复
Title: Enhancing endocannabinoid signalling in astrocytes promotes recovery from traumatic brain injury DOI: https://doi.org/10.1093/brain/awab310 创伤性脑损伤是阿尔茨海默病和痴呆...
2023/08/29